50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11797 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  832    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  51.96 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  53.02 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  56.09 
 
 		 391 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  55.42 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  53.35 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  50.87 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  49.12 
 
 		 403 aa  342  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  49.75 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  52.55 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  49.87 
 
 		 395 aa  328  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  45.71 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  44.99 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  41.03 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  48.16 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  41.28 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  41.28 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  41.28 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  41.28 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  41.03 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  46.14 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  40.77 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  40.51 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  40.77 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  47.86 
 
 		 427 aa  292  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  44.22 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  40.51 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  43.6 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  47 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  43.91 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  37.5 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  42.86 
 
 		 408 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  42.43 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  34.2 
 
 		 345 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  25.07 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.48 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  27.62 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  24.88 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  27.69 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  25.79 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  24.42 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  24.42 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  24.53 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  28.63 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  23.78 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  24.33 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.66 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.01 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  24.48 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  24.05 
 
 		 383 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>