54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1083 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  100 
 
 
345 aa  721    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  39.52 
 
 
390 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  39.82 
 
 
390 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  39.52 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  40.74 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  39.52 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  39.52 
 
 
402 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  35.35 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  35.45 
 
 
407 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.54 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  34.14 
 
 
401 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  33.93 
 
 
415 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  34.59 
 
 
411 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  35.78 
 
 
391 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  33.73 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  34.2 
 
 
411 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  33.94 
 
 
397 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  32.01 
 
 
419 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  32.23 
 
 
403 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  30.85 
 
 
444 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  34.66 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  31.49 
 
 
438 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  35.06 
 
 
393 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  32.24 
 
 
411 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  32.21 
 
 
407 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  34.01 
 
 
402 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  34.13 
 
 
400 aa  159  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  34.43 
 
 
427 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  34.75 
 
 
402 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1355  hypothetical protein  74.29 
 
 
83 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  21.19 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  19.7 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  24.41 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  20.82 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.22 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  18.59 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.22 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  18.96 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  25.85 
 
 
427 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  21.8 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  22.76 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  21.28 
 
 
420 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  19 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  22.79 
 
 
402 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  18.22 
 
 
387 aa  46.2  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  19.26 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  17.72 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  19.26 
 
 
383 aa  43.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  19.53 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>