58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0410 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  100 
 
 
415 aa  814    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  67.8 
 
 
401 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  64.62 
 
 
397 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  63.12 
 
 
407 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  61.92 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  61.98 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  58.56 
 
 
444 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  60.79 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  54.63 
 
 
403 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  56.23 
 
 
403 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  57.66 
 
 
427 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  57.66 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  56.86 
 
 
393 aa  359  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  57 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  50 
 
 
438 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  48.74 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  50.25 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  49.5 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  49.75 
 
 
411 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  51.82 
 
 
400 aa  316  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  53.22 
 
 
411 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  50.12 
 
 
402 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  40.2 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  40.2 
 
 
390 aa  285  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  39.95 
 
 
390 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  39.95 
 
 
390 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  39.44 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  39.44 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  39.44 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  39.19 
 
 
390 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  38.74 
 
 
402 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  39.19 
 
 
390 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  39.44 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  33.93 
 
 
345 aa  193  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  26.97 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  28.67 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  27 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.89 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.95 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.69 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  24.68 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  28.78 
 
 
381 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  27.47 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  26.72 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.55 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.24 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.91 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  24.91 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  25 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  24.72 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  29.41 
 
 
352 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  24.11 
 
 
371 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.11 
 
 
376 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  29.2 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  25.65 
 
 
349 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.17 
 
 
372 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  27.11 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  28.1 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>