68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  100 
 
 		 393 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  69.11 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  59.95 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  60.56 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  60.2 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  58.24 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  59.58 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  58.52 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  59.34 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  57.68 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  56.86 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  60.2 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  60.71 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  61.01 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  54.59 
 
 		 411 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  51.24 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  56.49 
 
 		 411 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  51.86 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  52.55 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  53.55 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  52.25 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  52.89 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  40.53 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  40.53 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  40.53 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  40.26 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  39.47 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  40 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  39.47 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  39.47 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  37.4 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.06 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.57 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  27.74 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  27.08 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  27.23 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  24.38 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  25.94 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  25 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  24.7 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  29.55 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  22.83 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  26.18 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  23.51 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  21.73 
 
 		 362 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  25 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  24.34 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.3 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.55 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  26.11 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  26.11 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.62 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.62 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  25.44 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.37 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  26.88 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.36 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  24.18 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  26.78 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.08 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.19 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.66 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  25.38 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  35.54 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  24.91 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>