70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1751 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  100 
 
 
397 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  76.07 
 
 
391 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  64.74 
 
 
407 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  64.91 
 
 
397 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  60.05 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  60.4 
 
 
401 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  61.98 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  55.95 
 
 
403 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  57.18 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  59.19 
 
 
402 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  57.68 
 
 
393 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  55.21 
 
 
403 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  57.72 
 
 
427 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  54.04 
 
 
411 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  56.82 
 
 
407 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  52.31 
 
 
419 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  51.36 
 
 
438 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  54.45 
 
 
411 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  48.83 
 
 
411 aa  338  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  49.87 
 
 
400 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  43.51 
 
 
390 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  42.86 
 
 
402 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  43 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  43.26 
 
 
390 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  43.26 
 
 
390 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  43.26 
 
 
390 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  43 
 
 
390 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  43.08 
 
 
390 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  48.83 
 
 
408 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  43 
 
 
390 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  42.49 
 
 
390 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  42.24 
 
 
390 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  48 
 
 
402 aa  315  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  36.04 
 
 
345 aa  202  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.61 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  27.65 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  27.6 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.29 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.81 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  27.41 
 
 
381 aa  63.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.74 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.39 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  23.57 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.14 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  24.2 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.64 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.69 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.48 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.7 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  23.92 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.7 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.38 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  24.33 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  26.45 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  23.97 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.63 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  23.72 
 
 
355 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  23.72 
 
 
355 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  21.32 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.73 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  23.93 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  23.23 
 
 
349 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  21.27 
 
 
362 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  26.24 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.01 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.23 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  23.65 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  25.4 
 
 
372 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  21.58 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.28 
 
 
371 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>