48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4702 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  100 
 
 
444 aa  842    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  60.82 
 
 
407 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  60.75 
 
 
391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  58.66 
 
 
401 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  61.4 
 
 
397 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  60.05 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  59.49 
 
 
415 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  59.16 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  58.47 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  58.93 
 
 
393 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  55.14 
 
 
395 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  53.15 
 
 
403 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  51.96 
 
 
411 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  53.22 
 
 
403 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  55.89 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  48.21 
 
 
419 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  50.23 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  48.24 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  51.63 
 
 
411 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  47.31 
 
 
438 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  48.8 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  49.1 
 
 
402 aa  312  7.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  35.43 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  35.9 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  35.9 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  35.9 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  35.66 
 
 
390 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  35.66 
 
 
390 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  35.43 
 
 
390 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  34.97 
 
 
390 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  34.97 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  35.48 
 
 
402 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  30.85 
 
 
345 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  26.2 
 
 
420 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  24.73 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  23.88 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.21 
 
 
372 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.43 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  22.61 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.86 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  22.83 
 
 
427 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  26.47 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  29.43 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  23.68 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02760  hypothetical protein  56.76 
 
 
1010 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.585729  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  25.95 
 
 
355 aa  43.1  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  25.95 
 
 
355 aa  43.1  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>