59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5489 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  100 
 
 
407 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  68.84 
 
 
397 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  64.9 
 
 
391 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  61.05 
 
 
444 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  64.74 
 
 
397 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  63.12 
 
 
415 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  61.6 
 
 
401 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  59.59 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  58.44 
 
 
395 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  54.66 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  60.2 
 
 
393 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  59.95 
 
 
402 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  58.94 
 
 
427 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  56.58 
 
 
407 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  53.38 
 
 
411 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  52.54 
 
 
419 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  51.96 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  50.24 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  51.87 
 
 
400 aa  349  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  49.4 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  47.68 
 
 
408 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  46.44 
 
 
402 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  40.26 
 
 
390 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  39.48 
 
 
390 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  39.48 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  39.48 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  39.48 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  39.74 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  39.48 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  38.75 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  39.22 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  39.22 
 
 
390 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.45 
 
 
345 aa  210  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.28 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  25.32 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  27.43 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  27.43 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.57 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.2 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.76 
 
 
380 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  21.73 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  23.22 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  25.06 
 
 
434 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.35 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.78 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.48 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  25.66 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  25.42 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  25 
 
 
349 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.83 
 
 
372 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  22.51 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  27.27 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.57 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  31.03 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  24.59 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  23.85 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.06 
 
 
371 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  24.5 
 
 
349 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>