60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4024 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  829    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  89.05 
 
 
402 aa  624  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  63.16 
 
 
403 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  58 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  57.86 
 
 
401 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  60.31 
 
 
395 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  58.44 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  58.94 
 
 
407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  60.2 
 
 
393 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  57.66 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  56.06 
 
 
391 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  57.72 
 
 
397 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  60.35 
 
 
407 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  54.84 
 
 
411 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  51.72 
 
 
419 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  55.81 
 
 
403 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  52.2 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  55.42 
 
 
400 aa  352  7e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  55.73 
 
 
411 aa  332  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  51.86 
 
 
402 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  47.86 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  50.65 
 
 
408 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  38.32 
 
 
390 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  39.24 
 
 
390 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  39.24 
 
 
390 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  39.2 
 
 
402 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  38.99 
 
 
390 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  39.24 
 
 
390 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  38.99 
 
 
390 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  37.82 
 
 
390 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  37.82 
 
 
390 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  38.48 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  36.72 
 
 
390 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  33.44 
 
 
345 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  28.74 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  25.19 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.81 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  28.37 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.95 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  27.08 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.71 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.77 
 
 
387 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  28.24 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.84 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.02 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  27.63 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.36 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  29.62 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  34.05 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  24.81 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  21.96 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.6 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.88 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  29.23 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  25.63 
 
 
432 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.75 
 
 
382 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  28 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.01 
 
 
371 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  27.01 
 
 
349 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>