62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0845 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
403 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  63.16 
 
 
427 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  63.66 
 
 
402 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  56.75 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  60.46 
 
 
395 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  59.95 
 
 
393 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  55.95 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  55.56 
 
 
397 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  56.74 
 
 
391 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  54.66 
 
 
407 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  56.02 
 
 
403 aa  388  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  52.68 
 
 
444 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  54.63 
 
 
415 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  52.56 
 
 
419 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  53.92 
 
 
438 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  51.43 
 
 
411 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  56.35 
 
 
407 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  52.96 
 
 
400 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  55.36 
 
 
411 aa  353  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  49.12 
 
 
411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  48.38 
 
 
402 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  48.08 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  39.37 
 
 
390 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  39.37 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  39.37 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  39.37 
 
 
390 aa  272  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  39.53 
 
 
390 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  39.11 
 
 
390 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  38.85 
 
 
390 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  38.85 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  39.11 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  38.58 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  38.18 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  33.73 
 
 
345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  25.74 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  25.06 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.56 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  24.91 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  25.38 
 
 
381 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.98 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.53 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  25.75 
 
 
437 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  25.48 
 
 
444 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.22 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.03 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  27 
 
 
349 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.99 
 
 
373 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.95 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.81 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  23.16 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.22 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.53 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.99 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  26.54 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  27.68 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  26.92 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  26.92 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  22.74 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.46 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.96 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.05 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.79 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>