69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  100 
 
 		 403 aa  778    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  59.59 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  58.96 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  60.2 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  56.02 
 
 		 403 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  55.5 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  57.92 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  59.58 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  53.22 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  55.21 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  56.23 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  54.64 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  50.91 
 
 		 411 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  47.49 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  58.29 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  47.98 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  55.81 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  52.08 
 
 		 411 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  48.59 
 
 		 402 aa  299  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  47.03 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  46.11 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  44.99 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  36.18 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  36.1 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  36.62 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  36.62 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  36.62 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  35.84 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  36.62 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  35.84 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  36.1 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  32.23 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.93 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.3 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  28.3 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.46 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.65 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  28.57 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  25.99 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.15 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.44 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  28.9 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.17 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  24.63 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.87 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.4 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.55 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.8 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.5 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  24.18 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.87 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.62 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  24.5 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  23.24 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  29.69 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.16 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.56 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.54 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.05 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  28.83 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  25.57 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  24.6 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.25 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.32 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  26.88 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  26.85 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1355  hypothetical protein  32.31 
 
 		 83 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>