66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0670 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  100 
 
 
411 aa  787    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  64.1 
 
 
400 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  62.59 
 
 
402 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  55.36 
 
 
403 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  54.8 
 
 
401 aa  363  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  56.96 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  51.62 
 
 
444 aa  355  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  54.64 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  54.5 
 
 
391 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  54.45 
 
 
397 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  54.08 
 
 
397 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  53.4 
 
 
403 aa  338  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  50.36 
 
 
407 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  52.75 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  51.82 
 
 
411 aa  326  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  56.38 
 
 
427 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  56.89 
 
 
402 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  53.71 
 
 
415 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  48.76 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  53.67 
 
 
407 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  46.51 
 
 
408 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  44.44 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  37.92 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  37.92 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  37.92 
 
 
390 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  37.92 
 
 
390 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  37.66 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  37.66 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  37.56 
 
 
390 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  37.92 
 
 
402 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  37.56 
 
 
390 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  37.08 
 
 
390 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  37.73 
 
 
390 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  34.59 
 
 
345 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.85 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  27.91 
 
 
434 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  29.64 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  27.13 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.56 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.37 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.61 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  23.96 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.63 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  25.19 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  22.96 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.6 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.64 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.61 
 
 
387 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  26.35 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  24.87 
 
 
402 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  25.66 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.25 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.83 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.01 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  24.87 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  28.12 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  25.65 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  26.36 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.56 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  27.15 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  20.39 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.13 
 
 
374 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  25.69 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  20.39 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1355  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.66 
 
 
371 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>