69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2456 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  810    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  51.43 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  53.93 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  54.59 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  51.56 
 
 		 397 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  50.52 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  51.96 
 
 		 407 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  50.13 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  48.01 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  50.91 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  54.84 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  48.42 
 
 		 419 aa  328  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  54.59 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  51.86 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  49.5 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  48.08 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  53.2 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  49.1 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  51.82 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  50.75 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  47.49 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  43.6 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  35.68 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  35.68 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  35.68 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  35.68 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  35.68 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  35.62 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  34.9 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  35.16 
 
 		 390 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  34.64 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  34.64 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  33.51 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  32.24 
 
 		 345 aa  170  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  25.97 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.74 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.97 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  24.56 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.02 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  24.05 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  25.78 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  25.59 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.73 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  32.97 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  21.88 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.97 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.64 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  26.85 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  24.19 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.25 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  29.05 
 
 		 372 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  21.04 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.11 
 
 		 362 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.32 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  25.29 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.13 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.37 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.78 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  24.62 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  24.21 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.38 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  27.59 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.07 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  31.82 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.62 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  22.75 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.72 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  29.28 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  25.57 
 
 		 349 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>