32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6102 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  80.47 
 
 
427 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  863    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  94.53 
 
 
402 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  46.81 
 
 
434 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  46.63 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  38.36 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  26.63 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  24.56 
 
 
411 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  24.73 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  24.75 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  24.18 
 
 
403 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  25.19 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  25.79 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  23.94 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  23.82 
 
 
401 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  22.03 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  23.91 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  22.76 
 
 
345 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.9 
 
 
387 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  23.53 
 
 
387 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  23.57 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  22.2 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  21.72 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  22.74 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  21.7 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.56 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  22.86 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.03 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.25 
 
 
371 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  22.42 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  22.75 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  25.95 
 
 
425 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>