69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2357 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  796    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  68.05 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  67.25 
 
 
397 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  62.75 
 
 
391 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  62.09 
 
 
407 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  60.4 
 
 
397 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  59.35 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  60.86 
 
 
395 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  56.86 
 
 
403 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  60.56 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  55.5 
 
 
403 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  58.35 
 
 
427 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  57.86 
 
 
402 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  55.31 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  50.87 
 
 
411 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  50.52 
 
 
411 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  51.76 
 
 
438 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  54.8 
 
 
411 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  49.37 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  49.76 
 
 
400 aa  325  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  50.49 
 
 
402 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  49.49 
 
 
408 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  40.67 
 
 
390 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  38.34 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  40.67 
 
 
390 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  40.67 
 
 
402 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  40.16 
 
 
390 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  39.9 
 
 
390 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  34.14 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  25.37 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  27.62 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.13 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.53 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  25.57 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  25.83 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.25 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  23.82 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.3 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  26.49 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.8 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.55 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.42 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.98 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.25 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.83 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  24.92 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  23.63 
 
 
371 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.76 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  24.26 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  22.58 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  22.03 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.33 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  23.2 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  30 
 
 
416 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  27.13 
 
 
351 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  30.91 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  30.91 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.28 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  26.61 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.52 
 
 
381 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  27.32 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.71 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.48 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  23.87 
 
 
366 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>