70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2954 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 400 aa  768    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  63.85 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  59.85 
 
 		 402 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  52.96 
 
 		 403 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  49.89 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  52.97 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  53.5 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  51.87 
 
 		 407 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  51.86 
 
 		 411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  49.51 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  50.13 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  56.3 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  55.42 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  51.82 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  53.55 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  49.87 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  48.87 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  47.03 
 
 		 403 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  50.87 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  48.59 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  46.14 
 
 		 411 aa  278  9e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  45.68 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  35.48 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  35.99 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  35.48 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  35.22 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  35.22 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  35.22 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  35.22 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  35.22 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  35.22 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  34.96 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  34.7 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  34.13 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  28.12 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.35 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.63 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  26.91 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  25.74 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  26.77 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.47 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  26.61 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.85 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  26.61 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  27.1 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.33 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.83 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  25.64 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  28.79 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.09 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.84 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  25.2 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  26.24 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  24.74 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  24.54 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.6 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.3 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.85 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  25.77 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.37 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.12 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.78 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.6 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  24.81 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  27.23 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  35.62 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  27.05 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  22.96 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  27.06 
 
 		 244 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  25.63 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>