46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  100 
 
 		 402 aa  775    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  62.59 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  59.85 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  55.61 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  51.35 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  49.44 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  49.88 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  52.1 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  49.25 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  51 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  47.68 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  53.25 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  49.61 
 
 		 403 aa  315  7e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  51.6 
 
 		 415 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  49.25 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  46.84 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  53.1 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  52.61 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  45.17 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  45.59 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  48.14 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  41.04 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  35.38 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  36.55 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  36.55 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  36.55 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  36.11 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  35.61 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  35.35 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  34.01 
 
 		 345 aa  186  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  24.75 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.94 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  24.75 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.42 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  26.23 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.86 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.48 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.92 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  26.92 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  23.04 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.82 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>