260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1634 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 380 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  28.21 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 368 aa  99.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  28.33 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 106 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.97 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.73 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  26.61 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.09 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.25 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  34.69 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 308 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  37.5 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  30.84 
 
 		 517 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1613  cupin 2 domain-containing protein  33.98 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0246689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2904  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 502 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.190431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 251 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 259 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2497  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 563 aa  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1458  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 504 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  45.61 
 
 		 291 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  36.45 
 
 		 263 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 993 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  36 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 		 745 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 		 745 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>