262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2366 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 370 aa  749    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.6 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  38.58 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  27.12 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  31.62 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.23 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.82 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  26.58 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  21.57 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.73 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 1201 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  31.52 
 
 		 1296 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.36 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 1121 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 309 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  34.69 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 322 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 301 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  30 
 
 		 1366 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 513 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.5 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 253 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3553  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 558 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566587  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 515 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  31.91 
 
 		 287 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  35.87 
 
 		 345 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  31.91 
 
 		 301 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>