291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3101 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 389 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.34 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.15 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  22.03 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  24.05 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  23 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  32.52 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  22.5 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  25.15 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.65 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  30.58 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  27.74 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.1 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  35.05 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 275 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 571 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 719 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  35.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  35.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  35.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  35.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  35.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 287 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 513 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 298 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  34.44 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.56 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 760 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 291 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 537 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  34.41 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  32.52 
 
 		 745 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.52 
 
 		 745 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  34.41 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 264 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  34.41 
 
 		 280 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>