More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1285 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 379 aa  771    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  25.91 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  25 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.43 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  24.5 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  49.53 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.52 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  28.99 
 
 		 328 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  40.57 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  37.38 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.47 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  29.93 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  38.95 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  28.86 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.95 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.31 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.77 
 
 		 1335 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.72 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 1201 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  28.12 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  35.79 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 940 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.35 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  34.62 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 537 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.38 
 
 		 285 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 319 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 315 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 258 aa  53.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>