More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0732 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  32.1 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  26.81 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.22 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  22.27 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1743  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  24.27 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  30.58 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  29.92 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  30.77 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  30.77 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.8 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  28.37 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 571 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  28.26 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  29.81 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.26 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>