More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0538 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 353 aa  708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 349 aa  424  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  28.4 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  32.93 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  41.58 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  26.65 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.54 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.66 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  22.8 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  30.51 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.63 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  32.11 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.58 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.04 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0632  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0334632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 1201 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  23.16 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 940 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 571 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 533 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 118 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  25.22 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 532 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.27 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>