More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1703 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  99.19 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  66.4 
 
 		 271 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  61.71 
 
 		 275 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  58.89 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 399 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 392 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  29.41 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 106 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  31.82 
 
 		 1296 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0359  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.524425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0179  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0264145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  30.1 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  31.4 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 399 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.93 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 791 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 934 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 367 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  34.31 
 
 		 380 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  35.11 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  38.2 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  29.51 
 
 		 1414 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  28.26 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  30.23 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>