More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3084 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  100 
 
 		 363 aa  730    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 548 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  20.32 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  22.87 
 
 		 779 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  23.86 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  21.24 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  23.12 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 1201 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 775 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  24.5 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  35.51 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  35.51 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  20.9 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  21.22 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 544 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 544 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  38.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  21.43 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 764 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.46 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  19.91 
 
 		 766 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 773 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 532 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  21.7 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  22.22 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  30.77 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  30.77 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.69 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  32.69 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>