More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0404 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 399 aa  785    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.47 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.19 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  28.13 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  38.76 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  25.62 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  38.4 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  38.58 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  28.21 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 106 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  30.46 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.14 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 274 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  23.31 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 275 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 1201 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2102  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 217 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  31.5 
 
 		 1296 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  21.33 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.13 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 253 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.61 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 719 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.38 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1108  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  33.33 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000971871  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  27.88 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 296 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 287 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 304 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  19.14 
 
 		 291 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.33 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 571 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.44 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 316 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 745 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 118 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 513 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 745 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>