More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1287 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 368 aa  741    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  39.82 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  35.83 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  44.33 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  43.14 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  31.2 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  30.16 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 993 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 745 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 745 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.91 
 
 		 1335 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  28.22 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  32.81 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000822  transcriptional regulator AraC family  33.93 
 
 		 288 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.184938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  32.12 
 
 		 1296 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 286 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  34.04 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.62 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 760 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.2 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  32.98 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  44.29 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.86 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 151 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  32.98 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 509 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.84 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.5 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2653  AraC family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 78 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40 
 
 		 497 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 157 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 233 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  28.45 
 
 		 209 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>