More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3336 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 367 aa  752    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.19 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  35.45 
 
 		 1374 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  30.63 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0179  AraC family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0264145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.63 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.25 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 571 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 760 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  28.45 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0868  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  32.99 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 1349 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  25.85 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  30.93 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  23.37 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  22.36 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  28.27 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>