More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2584 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 357 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  86.27 
 
 		 335 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  38.46 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  33.24 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.28 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 106 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  28.32 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  31.52 
 
 		 1296 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3580  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  38.55 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  30.48 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.55 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  36.9 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  37.5 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  27.69 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4030  helix-turn-helix domain-containing protein  33.75 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>