More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3712 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  38.23 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  39.07 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 379 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  27.27 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  37.08 
 
 		 1374 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  33.91 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0027  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  25.41 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  34.91 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  45.59 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  45.59 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  34.12 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.17 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 773 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>