More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4147 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 438 aa  904    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  23.63 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.86 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.88 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 274 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  25.76 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  28.78 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  26.28 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.01 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  24.67 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  30.51 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  30.61 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 106 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  30.61 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  26.42 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 760 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  25.34 
 
 		 304 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.92 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 288 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 303 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3553  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 558 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 154 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  27.19 
 
 		 1335 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 120 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 250 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0359  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.524425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.43 
 
 		 290 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 306 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 294 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 301 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 162 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 157 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 250 aa  53.5  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  25.83 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>