More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2515 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 373 aa  726    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  31.11 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  31.45 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  32.16 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.67 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  31.01 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.44 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.27 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.73 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.79 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3661  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 289 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 537 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 		 106 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 277 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2653  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 78 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 292 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 168 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 164 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 148 aa  52.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  30 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>