More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0664 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 422 aa  851    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  25.52 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 376 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.66 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  23.38 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  27.99 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 106 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  37.23 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  30.25 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  22.03 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  33.02 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.11 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  18.48 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  29.89 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  22.87 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  29.89 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 1201 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  29.09 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 275 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0632  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0334632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 310 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 270 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 533 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>