127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0106 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 394 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.52 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.7 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  25.92 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  24.64 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 353 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  25.06 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  28 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  31.58 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.1 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.8 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  24.81 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3028  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 558 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.360206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  22.69 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  31.76 
 
 		 106 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  24.61 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 282 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.33 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.55 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.37 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 282 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 331 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  31 
 
 		 287 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 571 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 318 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 519 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 313 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1972  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000433091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  30.49 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 773 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>