39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3028 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3028  response regulator receiver protein  100 
 
 		 558 aa  1150    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.360206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4364  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3553  TPR repeat-containing protein  41.5 
 
 		 558 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1291  response regulator receiver protein  22.33 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.655637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35 
 
 		 389 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 406 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 285 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.83 
 
 		 394 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 362 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 269 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 274 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  27.12 
 
 		 328 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 274 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 519 aa  47  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1972  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 701 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000433091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.41 
 
 		 991 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.19 
 
 		 389 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 247 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.78 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.78 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.78 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.78 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.78 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  27.78 
 
 		 280 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.78 
 
 		 280 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 279 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 392 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>