39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4364 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4364  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1133    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3553  TPR repeat-containing protein  51.81 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3028  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 558 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.360206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1291  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.655637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 779 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.51 
 
 		 389 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 269 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 398 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 285 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 267 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 259 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 233 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  28.95 
 
 		 328 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 390 aa  47.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 519 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 386 aa  47  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 		 381 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  33.7 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 277 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 277 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 274 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 537 aa  45.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  22.09 
 
 		 274 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 275 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 278 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 274 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 534 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 532 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  21.74 
 
 		 257 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>