123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1291 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1291  response regulator receiver protein  100 
 
 		 585 aa  1155    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.655637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4364  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3553  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3028  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.360206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.87 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 538 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  25 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  24.74 
 
 		 377 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 292 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 253 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 272 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.1 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  24.1 
 
 		 271 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 252 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 266 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  25 
 
 		 328 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 284 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 298 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 271 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 271 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 782 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 535 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 285 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  29.47 
 
 		 261 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.77 
 
 		 289 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 313 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 265 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 266 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 266 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 266 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.62 
 
 		 292 aa  47.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 438 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  27.47 
 
 		 537 aa  47.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1550 aa  47.4  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 231 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 231 aa  47  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 231 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  34.83 
 
 		 507 aa  47  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 231 aa  47  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 231 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 247 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 238 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 294 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 532 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 313 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 252 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.55 
 
 		 394 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 291 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 507 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 274 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  22.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 275 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 233 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 381 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 274 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.83 
 
 		 281 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 327 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 264 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 		 267 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  22.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 515 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 556 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 517 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 317 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 297 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.83 
 
 		 309 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 534 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 985 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 266 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 266 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 349 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 		 354 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>