More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2674 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  73.95 
 
 		 269 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  73.66 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  74.05 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  74.33 
 
 		 274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  66.3 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  66.01 
 
 		 294 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 247 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  31.75 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  26.12 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  24.46 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  34.91 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 106 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.56 
 
 		 389 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  35.87 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.44 
 
 		 1370 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.4 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3204  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 382 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 513 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 515 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 120 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 359 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 940 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 379 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.03 
 
 		 1340 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 392 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 791 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 532 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1291  response regulator receiver protein  21.68 
 
 		 585 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.655637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0839  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.2 
 
 		 497 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>