More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1846 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1846  diguanylate cyclase  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1073  diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.15 
 
 		 557 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1834  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 571 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000228382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1189  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 510 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.906384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3231  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.21 
 
 		 313 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.458607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0627  diguanylate cyclase  37.33 
 
 		 1052 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.256226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3034  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 522 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  42.28 
 
 		 411 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.72 
 
 		 459 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 		 643 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0735  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.57 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 		 643 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1158  GGDEF family protein  30.65 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1964  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.13 
 
 		 884 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.826699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  32.43 
 
 		 458 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  36.91 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3263  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.73 
 
 		 368 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.74 
 
 		 675 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2858  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.73 
 
 		 368 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0640037  hitchhiker  0.00351788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0476  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 383 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3978  diguanylate cyclase  32.53 
 
 		 448 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1690  diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 331 aa  85.9  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3864  diguanylate cyclase  32.53 
 
 		 448 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315138  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.32 
 
 		 464 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2165  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000162389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  31.48 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.77 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4490  diguanylate cyclase  34.87 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1652  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.749875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1586  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.25 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1933  sensory box protein  33.94 
 
 		 692 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0364295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.63 
 
 		 550 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  34.34 
 
 		 794 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.29 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0406  periplasmic sensor diguanylate cyclase (GGDEF)  34.87 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6762  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0806  GGDEF family protein  31.95 
 
 		 443 aa  82  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1646  GGDEF family protein  34.18 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.85 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0817  diguanylate cyclase  27.72 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1763  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.45 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.816449  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4599  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.711309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2060  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.72 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0175  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.78 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.14726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2355  hypothetical protein  35.09 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2798  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3959  diguanylate cyclase  31.41 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.269646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.05 
 
 		 696 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.05 
 
 		 696 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56280  hypothetical protein  29.93 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5857  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.26 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2490  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.19 
 
 		 962 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.297128  normal  0.0871585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0280  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.84 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0265413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2429  diguanylate cyclase  34.26 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0271208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  32.21 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2449  GGDEF domain-containing protein  35.04 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3308  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  32.5 
 
 		 908 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  32.05 
 
 		 611 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1675  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 		 1073 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  34.21 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3264  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0392  putative signaling protein  37.58 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0487  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.468611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.39 
 
 		 1254 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 852 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  34.29 
 
 		 490 aa  79.7  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 835 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1324  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.43 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.799769  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.65 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2624  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0567  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000656533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2691  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000361168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  28 
 
 		 491 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0689  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.26 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  33.11 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.2 
 
 		 1036 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.45 
 
 		 648 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5313  diguanylate cyclase  30.22 
 
 		 361 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4114  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.12 
 
 		 681 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.48 
 
 		 772 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3237  diguanylate cyclase  27.47 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1498  diguanylate cyclase  32.99 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2885  diguanylate cyclase  32.99 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101841  normal  0.0224227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2451  diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.357432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3132  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.81 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0536  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.190341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3822  diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1467  diguanylate cyclase  32.99 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2861  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1462  diguanylate cyclase  32.99 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1404  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>