More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5313 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5313  diguanylate cyclase  100 
 
 		 361 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 612 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  29.09 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  28.79 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.65 
 
 		 908 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  33.2 
 
 		 554 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  31.54 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.23 
 
 		 755 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  33.89 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  37.04 
 
 		 451 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3231  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.67 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.458607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0760  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 495 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5012  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.77 
 
 		 557 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1396  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3390  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.1 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.861092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  34.55 
 
 		 719 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  35 
 
 		 719 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44470  transmembrane sensor cyclic di-GMP signal transduction protein  39.33 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  38.38 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2469  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  32.64 
 
 		 882 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  32.66 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1583  GGDEF domain-containing protein  40.46 
 
 		 472 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 491 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.12 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  36.22 
 
 		 569 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3236  hypothetical protein  39.77 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0104131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  35.63 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.53 
 
 		 805 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00432386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3752  diguanylate cyclase  38.96 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3412  hypothetical protein  39.77 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0269335  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.23 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.27 
 
 		 814 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  36.41 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.75 
 
 		 730 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4127  diguanylate cyclase  31.41 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0339065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0413  diguanylate cyclase  42.31 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4153  diguanylate cyclase  31.41 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0175  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.78 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.14726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  38.85 
 
 		 559 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4011  diguanylate cyclase  35.61 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1012  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0093  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.12 
 
 		 665 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.86 
 
 		 884 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.39821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  35.67 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.9 
 
 		 550 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3406  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 719 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  37.85 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  37.85 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  39.77 
 
 		 743 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  37.85 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1983  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.88 
 
 		 1353 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103002  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.47 
 
 		 620 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 385 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  40 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  40 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3780  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.85 
 
 		 842 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0280  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.05 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0265413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4809  diguanylate cyclase  36.02 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.780327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  39.75 
 
 		 568 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4523  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114375  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 758 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.94 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0094  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 		 602 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  36.32 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0489  diguanylate cyclase  26.26 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0495  diguanylate cyclase  38.69 
 
 		 574 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.355875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.06 
 
 		 935 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.74 
 
 		 1114 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2010  diguanylate cyclase  27.63 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.42 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  35.12 
 
 		 814 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2984  GGDEF domain-containing protein  36.5 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.301535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.86 
 
 		 762 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2858  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.36 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0640037  hitchhiker  0.00351788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3263  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.36 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.77 
 
 		 743 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.97 
 
 		 757 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  29.51 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 508 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  35.93 
 
 		 1534 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 516 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>