More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2858 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2858  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 		 368 aa  762    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0640037  hitchhiker  0.00351788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3263  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 		 368 aa  762    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0689  diguanylate cyclase with GAF sensor  57.23 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1396  diguanylate cyclase  53.03 
 
 		 356 aa  362  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4515  diguanylate cyclase  50.42 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  50.68 
 
 		 565 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2478  hypothetical protein  50.23 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  56.67 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  57.04 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3532  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3620  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 571 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 1022 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.78 
 
 		 557 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 570 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.05 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3629  GAF domain-containing protein  37.74 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3922  putative GAF sensor protein  40.85 
 
 		 172 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.36 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3912  GAF domain protein  40.69 
 
 		 170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3340  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.19 
 
 		 607 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  37.02 
 
 		 620 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.47 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  42.47 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.72 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  41.78 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  42.28 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.76 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.28 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  41.36 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.69 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.62 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  39.56 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1198  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000754903  normal  0.715416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  27.47 
 
 		 462 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 		 1637 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.08 
 
 		 1114 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  27.47 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.48 
 
 		 947 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  40.25 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 		 1643 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3853  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0518051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.02 
 
 		 639 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  35.47 
 
 		 882 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  39.26 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4246  GAF domain-containing protein  37.78 
 
 		 202 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.82 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 215 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.81 
 
 		 761 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.66 
 
 		 769 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0542  diguanylate cyclase  39.1 
 
 		 285 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.53 
 
 		 1093 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  37.63 
 
 		 937 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.27 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3175  sensory box protein  26.72 
 
 		 627 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0190  diguanylate cyclase  34.29 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2183  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.68 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645275 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.61 
 
 		 538 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.89 
 
 		 797 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0407  GGDEF domain-containing protein  35.53 
 
 		 873 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0669941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2887  GGDEF domain-containing protein  38.27 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  32.94 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  35.61 
 
 		 689 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  39.51 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  39.77 
 
 		 808 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1222  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.36 
 
 		 815 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4644  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.72 
 
 		 904 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.374969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.18 
 
 		 882 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.212751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  36 
 
 		 495 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0231  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.14 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.16 
 
 		 875 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00996719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.14 
 
 		 874 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 614 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3057  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  37.14 
 
 		 841 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0216  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.14 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  35.54 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.8 
 
 		 709 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 937 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 464 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  36.93 
 
 		 555 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.16 
 
 		 842 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0240  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.57 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3370  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.98 
 
 		 860 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.742202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  33.85 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  33.99 
 
 		 627 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  35.29 
 
 		 629 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.88 
 
 		 1014 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.553063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 937 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.07 
 
 		 928 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.575219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  24.93 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.8 
 
 		 1338 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0211  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.59 
 
 		 638 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 565 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2797  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36 
 
 		 1020 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>