116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3488 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  85.19 
 
 		 845 aa  1411    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  100 
 
 		 840 aa  1693    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.68 
 
 		 854 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 868 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  37.47 
 
 		 960 aa  468  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  37.75 
 
 		 950 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 885 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  36.69 
 
 		 950 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 851 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  35.51 
 
 		 891 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  34.5 
 
 		 853 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 905 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 905 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  34.3 
 
 		 944 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 904 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 822 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 883 aa  321  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 796 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  28.7 
 
 		 698 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  27.59 
 
 		 725 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.89 
 
 		 1650 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.25 
 
 		 553 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.84 
 
 		 1772 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  33.6 
 
 		 809 aa  170  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.64 
 
 		 3298 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.02 
 
 		 3535 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.02 
 
 		 3419 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  30.84 
 
 		 447 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.66 
 
 		 3299 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.09 
 
 		 3537 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.69 
 
 		 1009 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 		 957 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  30.21 
 
 		 418 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.37 
 
 		 2637 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1060 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.74 
 
 		 828 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 949 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 991 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.14 
 
 		 1328 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 1162 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.48 
 
 		 1162 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 2741 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 2741 aa  97.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.48 
 
 		 919 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 916 aa  92.8  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 851 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.93 
 
 		 893 aa  88.6  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.32 
 
 		 532 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 1215 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  30.88 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  29.51 
 
 		 884 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 729 aa  77  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 854 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.02 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 846 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 937 aa  72.4  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 968 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.7 
 
 		 989 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1054 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1409 aa  70.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1024 aa  70.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.76 
 
 		 903 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1365 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  33.03 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  28.49 
 
 		 827 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 		 1186 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  26.8 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.67 
 
 		 1475 aa  64.7  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.68 
 
 		 1007 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 1135 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  32 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1036 aa  60.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  23.56 
 
 		 874 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1055 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1051 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 928 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1711 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1025 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 1476 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 994 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  25 
 
 		 1051 aa  55.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1171 aa  55.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.92 
 
 		 918 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.64 
 
 		 937 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1779 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 897 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 923 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 868 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1025 aa  53.5  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1247 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1246 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 1276 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  25.35 
 
 		 615 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  24.52 
 
 		 811 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  23.48 
 
 		 697 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  23.83 
 
 		 905 aa  51.2  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1039 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0254  hypothetical protein  85 
 
 		 46 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0233368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1077 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  23.9 
 
 		 883 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>