More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1365 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  37.74 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  40 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 287 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 307 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  25.3 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 408 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  44 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>