More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10234 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 229 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  77.29 
 
 		 229 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  77.29 
 
 		 229 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  74.01 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  79.44 
 
 		 228 aa  307  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  37.5 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.26 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  29.57 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  22.5 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  29.11 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>