More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5893 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 507 aa  1030    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  63.91 
 
 		 522 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  60.49 
 
 		 533 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  58.76 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  62.69 
 
 		 544 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  59.62 
 
 		 543 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  59.62 
 
 		 543 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  57.19 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  57.79 
 
 		 534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.58 
 
 		 538 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  56.24 
 
 		 566 aa  569  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  52.89 
 
 		 605 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  55.41 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  57.47 
 
 		 540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  59.77 
 
 		 550 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  58.3 
 
 		 531 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  52.54 
 
 		 593 aa  558  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  58.93 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  57.12 
 
 		 546 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  55.91 
 
 		 565 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.43 
 
 		 545 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  57.71 
 
 		 555 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  54.04 
 
 		 570 aa  545  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  54.66 
 
 		 576 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.83 
 
 		 511 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 560 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  52.55 
 
 		 568 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  54.63 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  52.85 
 
 		 609 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  54.83 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  52.78 
 
 		 533 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  53.54 
 
 		 587 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  54 
 
 		 560 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  54.17 
 
 		 599 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  52.11 
 
 		 544 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.1 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  52.9 
 
 		 570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  52.28 
 
 		 524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  52.21 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  51.5 
 
 		 640 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  56.01 
 
 		 532 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  54.74 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  53.43 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  52.12 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  54.08 
 
 		 539 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  54.08 
 
 		 539 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  52.39 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  54.08 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  48.28 
 
 		 563 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  53.47 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.45 
 
 		 607 aa  491  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 558 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  51.2 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 572 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  53.23 
 
 		 573 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  50.37 
 
 		 548 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  51.79 
 
 		 594 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.65 
 
 		 561 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  51.12 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  48.68 
 
 		 580 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  50.28 
 
 		 634 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.5 
 
 		 604 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  47.34 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  50.21 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  47.58 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 		 548 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.69 
 
 		 532 aa  352  7e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  43.65 
 
 		 555 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  42.97 
 
 		 547 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43 
 
 		 529 aa  346  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  42.22 
 
 		 543 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.31 
 
 		 553 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.62 
 
 		 525 aa  339  7e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.2 
 
 		 515 aa  339  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.65 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  40.82 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  43.03 
 
 		 548 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.64 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.1 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 		 735 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  43.07 
 
 		 537 aa  324  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 540 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  40.39 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  39.43 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  40.36 
 
 		 550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.03 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.37 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  41.47 
 
 		 537 aa  320  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.96 
 
 		 535 aa  319  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.55 
 
 		 541 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.15 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  39.92 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.88 
 
 		 550 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  41.74 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  41.47 
 
 		 537 aa  317  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  40.86 
 
 		 536 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  39.68 
 
 		 550 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>