More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1410 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 482 aa  969    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  54.87 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  52.45 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  51.52 
 
 		 476 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  32.29 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  31.14 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.51 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  20.63 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.3 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.16 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.38 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.7 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.94 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  32.14 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.27 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.95 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.69 
 
 		 403 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.62 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  21.46 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.66 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>