More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2872 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 982 aa  2001    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1034 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 1015 aa  333  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 981 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2026  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1068 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00076043  normal  0.701552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 951 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 904 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 966 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 944 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 951 aa  282  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 938 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 869 aa  280  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 904 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 897 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 957 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 952 aa  273  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 966 aa  273  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 873 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 969 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 930 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 930 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 930 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 873 aa  265  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.1 
 
 		 936 aa  260  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 901 aa  258  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 935 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 935 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 935 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 937 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 947 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 935 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 967 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 987 aa  240  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 933 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1015 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1088 aa  238  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 953 aa  239  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 908 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 912 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 853 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 853 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 853 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 1009 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 975 aa  227  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 939 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 875 aa  224  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.5 
 
 		 914 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 922 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 944 aa  220  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 1028 aa  217  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.95 
 
 		 969 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 976 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 869 aa  208  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 912 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  25.54 
 
 		 929 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 914 aa  204  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 824 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 942 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 924 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 948 aa  194  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 958 aa  193  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 958 aa  193  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 895 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 965 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 874 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 896 aa  184  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 867 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 867 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 961 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1007 aa  183  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 894 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 867 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 867 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.34 
 
 		 1007 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 946 aa  174  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 901 aa  172  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 849 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 1007 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 1007 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 966 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 935 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 950 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 866 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 904 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  37.83 
 
 		 839 aa  157  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 904 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 973 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 907 aa  157  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 981 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 998 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 941 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 941 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 941 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  38.72 
 
 		 907 aa  155  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  38.49 
 
 		 853 aa  152  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 836 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  37.96 
 
 		 855 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  39.74 
 
 		 709 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>