More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0105 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 689 aa  1343    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  55.07 
 
 		 690 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  52.03 
 
 		 690 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  52.03 
 
 		 690 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 929 aa  96.3  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 689 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 3145 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 732 aa  69.3  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.74 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.3 
 
 		 733 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.54 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.54 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 1737 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 363 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 363 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 313 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  29.88 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.88 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 4079 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.73 
 
 		 1979 aa  62  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  28.1 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  20.61 
 
 		 681 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1676 aa  61.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.19 
 
 		 850 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 878 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 1154 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.83 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.33 
 
 		 1056 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 3172 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 1486 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  26.82 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.15 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 886 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.12 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1276 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 515 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  33.83 
 
 		 695 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 3301 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 808 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1192 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.47 
 
 		 1694 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 323 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 927 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.06 
 
 		 883 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.43 
 
 		 1677 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.95 
 
 		 884 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 591 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 762 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  25.7 
 
 		 773 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 		 2240 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 597 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 707 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 		 344 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 344 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1406 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 444 aa  54.7  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.81 
 
 		 573 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  32.32 
 
 		 389 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 643 aa  54.3  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.51 
 
 		 1221 aa  54.3  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1069 aa  54.3  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 923 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 287 aa  53.5  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.13 
 
 		 1067 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 465 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  19.44 
 
 		 745 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 392 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 632 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 311 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 291 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 934 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 828 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.22 
 
 		 729 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 886 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 754 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 2262 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 416 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.71 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.36 
 
 		 887 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 681 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1138 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  25.25 
 
 		 905 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 268 aa  52  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 512 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 297 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 827 aa  51.6  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>