170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0978 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 509 aa  1041    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  34.53 
 
 		 487 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.33 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  22.68 
 
 		 712 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  22.93 
 
 		 475 aa  97.8  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 499 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.83 
 
 		 734 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 804 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  23.8 
 
 		 518 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 530 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.74 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.17 
 
 		 779 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 664 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.92 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.9 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  21.68 
 
 		 663 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  20.6 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  21.9 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.96 
 
 		 872 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.71 
 
 		 790 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.29 
 
 		 738 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  21.29 
 
 		 662 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  22.8 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  21.65 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  26.25 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.75 
 
 		 756 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.67 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.35 
 
 		 753 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 745 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  22.13 
 
 		 711 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 643 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 653 aa  73.6  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  21.84 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.49 
 
 		 721 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  21.11 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  22.54 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  20.33 
 
 		 663 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  22.84 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.35 
 
 		 806 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 642 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.3 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  21.05 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.39 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  20.89 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.15 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  0.0655667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.03 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  20.74 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  20.78 
 
 		 708 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.97 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  23.66 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.04 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.6 
 
 		 739 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  20.17 
 
 		 753 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  22.82 
 
 		 727 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.57 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.87 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  21.78 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  22.52 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  20.57 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.31 
 
 		 756 aa  61.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  21.32 
 
 		 770 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.02 
 
 		 741 aa  60.1  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.69 
 
 		 736 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  22.97 
 
 		 519 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  21.07 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  20.43 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  22.74 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  24.14 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  20.34 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.32 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  22.75 
 
 		 527 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  20.39 
 
 		 756 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 520 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.68 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.24 
 
 		 701 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  21.75 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 759 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.32 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  21.8 
 
 		 734 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  19.02 
 
 		 755 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  21.81 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  21.3 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.13 
 
 		 739 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  27.41 
 
 		 740 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>