56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3532 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  100 
 
 		 663 aa  1337    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  52.72 
 
 		 662 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.03 
 
 		 664 aa  695    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  52.57 
 
 		 662 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  91.7 
 
 		 663 aa  1213    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  21.88 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.69 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  20.9 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.1 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  18.69 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.37 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  20.05 
 
 		 753 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  21 
 
 		 530 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  20.96 
 
 		 779 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.01 
 
 		 720 aa  55.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  21.28 
 
 		 790 aa  55.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  21.39 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.87 
 
 		 722 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.12 
 
 		 790 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  20.83 
 
 		 518 aa  52  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  28.32 
 
 		 735 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  27 
 
 		 741 aa  51.2  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  23.2 
 
 		 763 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.58 
 
 		 741 aa  50.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  20.09 
 
 		 806 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3177  hypothetical protein  21.13 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  31.31 
 
 		 215 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.88 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.88 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.88 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.1 
 
 		 469 aa  47.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.27 
 
 		 499 aa  47.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.44 
 
 		 736 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.22 
 
 		 736 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 804 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  21.6 
 
 		 507 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  22.48 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 222 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  19.42 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.36 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.36 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 222 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  21.33 
 
 		 746 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.94 
 
 		 741 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  21.37 
 
 		 532 aa  44.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 761 aa  44.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  21.61 
 
 		 472 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.41 
 
 		 730 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25.1 
 
 		 753 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>