70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3177 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4029  hypothetical protein  83.84 
 
 		 722 aa  1150    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 726 aa  1425    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 804 aa  88.6  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.16 
 
 		 806 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  21.85 
 
 		 759 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.99 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.59 
 
 		 743 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.63 
 
 		 779 aa  63.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  23 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.01 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.74 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.18 
 
 		 790 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 		 246 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.34 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.68 
 
 		 736 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3703  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.72 
 
 		 729 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000380193  normal  0.301221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.32 
 
 		 720 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  22.49 
 
 		 730 aa  53.9  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  26.23 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  22.88 
 
 		 820 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  23.49 
 
 		 530 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 279 aa  51.2  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.17 
 
 		 734 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 664 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  20.43 
 
 		 797 aa  51.2  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.35 
 
 		 770 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.07 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.49 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.1 
 
 		 727 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  21.4 
 
 		 662 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  20.53 
 
 		 662 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.66 
 
 		 736 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  20.06 
 
 		 721 aa  48.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24.18 
 
 		 727 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.8 
 
 		 480 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  25 
 
 		 663 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 		 750 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 734 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 761 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  22.12 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5483  chromosome partitioning ATPase  30.65 
 
 		 213 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25.96 
 
 		 734 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  23.89 
 
 		 229 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 576 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.31 
 
 		 822 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.27 
 
 		 745 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  32.73 
 
 		 224 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.16 
 
 		 747 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 734 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.9 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.56 
 
 		 726 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.56 
 
 		 790 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  25.78 
 
 		 734 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.21 
 
 		 463 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.97 
 
 		 741 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.18 
 
 		 759 aa  45.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.24 
 
 		 726 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  22.33 
 
 		 723 aa  44.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.39 
 
 		 756 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.84 
 
 		 746 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  22.93 
 
 		 741 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  30.64 
 
 		 722 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.93 
 
 		 741 aa  44.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.97 
 
 		 741 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  22.38 
 
 		 741 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 735 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  24.87 
 
 		 232 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.38 
 
 		 741 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  22.38 
 
 		 741 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>